Екатерина Богомилова завършва бакалавърска степен по специалност „Икономика на отбраната и сигурността“ в УНСС (2008), магистърска степен по специалност „На-ционална и регионална сигурност“, специализация: „Управление на кризи“ – Национален военен университет „Васил Левски“, В. Търново (2010) и магистърска степен по  „Финансов контрол“ в УНСС (2010). Придобива научната степен „доктор“ през 2014 г. Научните ѝ интереси са в областта на ядрената сигурност, управлението на извънредните ситуации и анализа на нормативните системи на кризисния мениджмънт. Научен секретар е на катедра „Национална и регионална сигурност“ в периода 2015 – 2018 г. От 2016 г. е координатор на международна магистърска програма „Икономика на отбраната и сигурността“, със специализация „Ядрена сигурност“.